汉中知府邓梦琴赏识王行俭的品行与才干，极力给上级举荐这位良臣能吏，希望他能得到提拔重用。

据《续修南郑县志》记载，公元1794年，王行俭调任三原知县。三原官场生态和社会环境与先前的南郑没有两样，或许是王行俭急于打开工作局面，就把南郑任职时的方法和经验照搬过来，结果，众人抱团给他罗织罪名。新任道台偏听偏信，直接把王行俭免掉了。没了饭碗和栖身之所，王行俭想回老家，没有盘缠路费，要不是一个仰慕他、在本地做小本生意的汉中乡党资助，他连吃饭和住宿都成了问题。

邓梦琴获悉王行俭的遭遇非常懊悔，他不忍心王行俭无依无靠漂泊关中，便立即写了一封信，叮嘱心腹快马加鞭务必把信交到王行俭的手上。信件的大概意思是：听说你遭人构陷丢了官职，我心里很是难过。时下，仕途变故已然无法更改，但日子还要过下去，不如回汉中做个教书先生，这样，你既能挣点银两安稳度日，也能施展平生所学培育学子，诚心邀约，千万莫辞。王行俭没有更好的选择，便接受了邓梦琴的邀请，从容地走进汉南书院，以身垂范，尽心尽力教授学生。

世事无常，人生起伏。王行俭原以为会在汉南书院终老，谁料，“白莲教匪乱”使他的人生再次转向。

嘉庆元年（1796年），白莲教首领姚之富聚众造反，一时间，战火蔓延、局势动荡，陕南紧邻战乱区域，瞬间进入紧急戒严状态，百姓人心惶惶，生灵岌岌可危。眼瞅着兵戈扰攘，烽烟四起，王行俭那颗处于休眠状态的报效家国之心被唤醒了，他拒绝了邓梦琴的挽留，果决地放下书本和教鞭投身军营，决意以瘦弱之躯守护一方百姓。

次年五月，白莲教叛军窜入陕西境内，大肆侵扰商州、兴安（陕西安康）等州县，烧杀抢掠、残害百姓，陕南局势瞬间危急。王行俭临危受命，率军驻守洵阳县赵家湾，同年闰六月，又奉命移守平利县八仙河，由于军纪严明，将士同心，防守部署周密得当，使得贼寇不敢贸然进犯。同年八月，延绥道台温公奉命前往竹溪县追捕残余叛匪，肃清乱世余孽。王行俭主动请缨随军同行，剿匪任务顺利完成后，大军返程途经关垭，恰逢守关将领突发重病，无法主持军务，便恳请王行俭暂代其职务把守关隘，他没有丝毫犹豫，当即爽快应允。

关垭六十里外的土关是出入陕南的咽喉要道，自古也是兵家必争之地，可驻防士兵仅有百余个。九月初，陕西巡抚正式下发公文，传令王行俭率领六百名乡勇，火速前往土关协助守御。公文刚刚送达营中，侦察兵士就火急火燎地报告，说发现大批叛军正从汝河一路疾驰，气势汹汹直奔土关而来。军情紧急，王行俭当机立断，连夜率领麾下乡勇星夜奔赴土关，第一时间与都司赵禧合兵一处，迅速排布防线，严阵以待。

第二天拂晓，叛军如同蜂群，密密麻麻地扑向关隘，王行俭毫无惧色，亲自率众冲杀迎战，一时间，枪炮齐鸣，声震山谷。战事自清晨鏖战至午后，守军奋勇杀敌、誓死坚守，斩杀叛军不计其数，狠狠挫败了敌军的嚣张气焰。叛军从正面久攻不下，便改变了策略，分派部分兵力沿小路攀登至山岭，悄悄绕到守军背后偷袭。王行俭与赵禧当即果断分兵，各带一队乡勇阻击前后敌军。双方短兵相接、近身肉搏，战场极其惨烈，最终，守军没有外援寡不敌众，被叛军层层围困，都司赵禧奋战到底，血染沙场，壮烈牺牲。王行俭身受十几处重伤，耗尽最后一丝气力轰然倒地，以身殉国。

噩耗传遍陕南，四方文士、乡绅、百姓无不悲痛，众人感念其一生清廉、爱民恤民的仁政，感佩其临危赴死、忠勇报国的气节，纷纷自发设立灵位祭拜。陕西巡抚把王行俭的忠烈事迹详尽奏报朝廷，嘉庆皇帝阅后动容不已，亲笔御批，盛赞王行俭气节可嘉、忠勇可敬、令人惋惜，并破例按照知州规格给予优厚抚恤，特授予其子云骑尉世袭爵位，准许其子孙世代承袭。

王行俭以廉立身、以勤理政、以忠殉国，是传世清官廉吏典范，后世史家景仰其品德与节操，把他的功绩与事迹分别载入《清史稿·忠义列传》《光绪·续平利县志·人物》《东华录》和《续修南郑县志·政治志》中，让后人铭记、子孙镜鉴。